Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA4P05014 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms