Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LTAP01374 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LTAP01374 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTAP01374 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms