Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHOX2AO14813 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms