Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms