Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UMAD1C9J7I0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms