Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ISPDA4D126 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISPDA4D126 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms