Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CACNB1Q02641 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms