RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495129.2

RPL23AP54-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP54, Length 419 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP54-201ENST00000495129 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
RPL23AP54-201ENST00000495129 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.62□□□□□ -0.55
RPL23AP54-201ENST00000495129 POTEDQ86YR6 584 aa11.01□□□□□ -0.65
RPL23AP54-201ENST00000495129 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RPL23AP54-201ENST00000495129 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RPL23AP54-201ENST00000495129 FOXD1Q16676 465 aa9.64□□□□□ -0.87
RPL23AP54-201ENST00000495129 MSH5O43196 834 aa9.41□□□□□ -0.9
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.35□□□□□ -0.91
RPL23AP54-201ENST00000495129 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.02□□□□□ -0.97
RPL23AP54-201ENST00000495129 ADRA2BP18089 450 aa8.99□□□□□ -0.97
RPL23AP54-201ENST00000495129 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RPL23AP54-201ENST00000495129 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RPL23AP54-201ENST00000495129 POTEHQ6S545 545 aa8.4□□□□□ -1.06
RPL23AP54-201ENST00000495129 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RPL23AP54-201ENST00000495129 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RPL23AP54-201ENST00000495129 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.2□□□□□ -1.1
RPL23AP54-201ENST00000495129 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.18□□□□□ -1.1
RPL23AP54-201ENST00000495129 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.02□□□□□ -1.13
RPL23AP54-201ENST00000495129 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RPL23AP54-201ENST00000495129 RNF39Q9H2S5 420 aa7.96□□□□□ -1.14
RPL23AP54-201ENST00000495129 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RPL23AP54-201ENST00000495129 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RPL23AP54-201ENST00000495129 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RPL23AP54-201ENST00000495129 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RPL23AP54-201ENST00000495129 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.75□□□□□ -1.17
RPL23AP54-201ENST00000495129 KCNA4P22459 653 aa7.74□□□□□ -1.17
RPL23AP54-201ENST00000495129 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.73□□□□□ -1.17
RPL23AP54-201ENST00000495129 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC4A2P04920 1241 aa7.42□□□□□ -1.22
RPL23AP54-201ENST00000495129 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RPL23AP54-201ENST00000495129 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RPL23AP54-201ENST00000495129 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.3□□□□□ -1.24
RPL23AP54-201ENST00000495129 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPL23AP54-201ENST00000495129 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RPL23AP54-201ENST00000495129 APLP2Q06481 763 aa7.26□□□□□ -1.25
RPL23AP54-201ENST00000495129 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RPL23AP54-201ENST00000495129 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPL23AP54-201ENST00000495129 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.22□□□□□ -1.25
RPL23AP54-201ENST00000495129 CAPN15O75808 1086 aa7.21□□□□□ -1.26
RPL23AP54-201ENST00000495129 DSG3P32926 999 aa7.18□□□□□ -1.26
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZBTB22O15209 634 aa7.12□□□□□ -1.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RPL23AP54-201ENST00000495129 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.04□□□□□ -1.28
RPL23AP54-201ENST00000495129 ABCB7O75027 752 aa7.03□□□□□ -1.28
RPL23AP54-201ENST00000495129 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.03□□□□□ -1.28
RPL23AP54-201ENST00000495129 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RPL23AP54-201ENST00000495129 POLA2Q14181 598 aa6.97□□□□□ -1.29
RPL23AP54-201ENST00000495129 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.92□□□□□ -1.3
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RPL23AP54-201ENST00000495129 LHX8Q68G74 356 aa6.89□□□□□ -1.31
RPL23AP54-201ENST00000495129 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP54-201ENST00000495129 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.84□□□□□ -1.31
RPL23AP54-201ENST00000495129 HAX1O00165 279 aa6.77□□□□□ -1.33
RPL23AP54-201ENST00000495129 FBLN2P98095 1184 aa6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP54-201ENST00000495129 OSCARQ8IYS5 282 aa6.74□□□□□ -1.33
RPL23AP54-201ENST00000495129 AKT1S1Q96B36 256 aa6.74□□□□□ -1.33
RPL23AP54-201ENST00000495129 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPDYE6P0CI01 402 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP54-201ENST00000495129 EVX2Q03828 476 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP54-201ENST00000495129 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP54-201ENST00000495129 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RPL23AP54-201ENST00000495129 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.62□□□□□ -1.35
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RPL23AP54-201ENST00000495129 PITPNM1O00562 1244 aa6.56□□□□□ -1.36
RPL23AP54-201ENST00000495129 POTEMA6NI47 508 aa6.54□□□□□ -1.36
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RPL23AP54-201ENST00000495129 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.52□□□□□ -1.37
RPL23AP54-201ENST00000495129 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
RPL23AP54-201ENST00000495129 POTEGQ6S5H5 508 aa6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP54-201ENST00000495129 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
RPL23AP54-201ENST00000495129 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL23AP54-201ENST00000495129 GABBR2O75899 941 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP54-201ENST00000495129 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL23AP54-201ENST00000495129 PRR29P0C7W0 189 aa6.39□□□□□ -1.39
RPL23AP54-201ENST00000495129 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.39□□□□□ -1.39
RPL23AP54-201ENST00000495129 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RPL23AP54-201ENST00000495129 PROM2Q8N271 834 aa6.38□□□□□ -1.39
RPL23AP54-201ENST00000495129 POTEIP0CG38 1075 aa6.33□□□□□ -1.4
RPL23AP54-201ENST00000495129 CHADLQ6NUI6 762 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL23AP54-201ENST00000495129 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL23AP54-201ENST00000495129 OTUD5Q96G74 571 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL23AP54-201ENST00000495129 CREBZFQ9NS37 354 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL23AP54-201ENST00000495129 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RPL23AP54-201ENST00000495129 FKBP8Q14318 412 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL23AP54-201ENST00000495129 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RPL23AP54-201ENST00000495129 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RPL23AP54-201ENST00000495129 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
RPL23AP54-201ENST00000495129 CLCN6P51797 869 aa6.18□□□□□ -1.42
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RPL23AP54-201ENST00000495129 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RPL23AP54-201ENST00000495129 PLEKHG5O94827 1062 aa6.13□□□□□ -1.43
RPL23AP54-201ENST00000495129 FBXO3Q9UK99 471 aa6.13□□□□□ -1.43
RPL23AP54-201ENST00000495129 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPL23AP54-201ENST00000495129 MIER1Q8N108 512 aa6.12□□□□□ -1.43
RPL23AP54-201ENST00000495129 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms