Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA2-201ENST00000394576 4605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCY1A3-208ENST00000511507 2552 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM196A-203ENST00000614311 4335 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOM2-212ENST00000523438 3328 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STK36-207ENST00000440309 4721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL157714.2-203ENST00000438275 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPY-201ENST00000225992 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MORN5-201ENST00000373764 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR922-201ENST00000401223 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBB8P2-201ENST00000402141 495 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079834.1-201ENST00000414016 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC244098.1-201ENST00000436499 275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 COX7A1-202ENST00000437291 407 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms