Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AUP1Q9Y679 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AUP1Q9Y679 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms