Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRBP1Q9UHY1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NRBP1Q9UHY1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms