Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PUF60Q9UHX1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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