Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms