Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms