Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms