Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms