Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM6SF1Q9BZW5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms