Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf16Q9BUW7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms