Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBBP8Q99708 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBBP8Q99708 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms