Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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