Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms