Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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