Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
REEP3Q6NUK4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms