Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TMEM78Q5T7P6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM78Q5T7P6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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