Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGD3Q5JSP0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGD3Q5JSP0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms