Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB6CQ53S08 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB6CQ53S08 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms