Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EDRF1Q3B7T1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms