Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC142Q17RM4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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