Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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