Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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