Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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