Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC173Q0VFZ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms