Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNAQ00169 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms