Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX17P56962 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX17P56962 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX17P56962 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX17P56962 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX17P56962 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX17P56962 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX17P56962 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
STX17P56962 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX17P56962 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX17P56962 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX17P56962 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms