Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAX9P55771 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAX9P55771 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms