Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF6P49848 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF6P49848 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF6P49848 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms