Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms