Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms