Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJC1P36383 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJC1P36383 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJC1P36383 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJC1P36383 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms