Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RCVRNP35243 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RCVRNP35243 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms