Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABRA5P31644 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA5P31644 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms