Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GCAP28676 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GCAP28676 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GCAP28676 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GCAP28676 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GCAP28676 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCAP28676 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms