Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MYF6P23409 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MYF6P23409 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MYF6P23409 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MYF6P23409 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MYF6P23409 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYF6P23409 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYF6P23409 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYF6P23409 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MYF6P23409 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms