Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCNA2P20248 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms