Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL5P13501 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL5P13501 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL5P13501 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL5P13501 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL5P13501 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL5P13501 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms