Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOC1P02654 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOC1P02654 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC1P02654 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC1P02654 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC1P02654 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC1P02654 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC1P02654 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC1P02654 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms