Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX15O60248 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOX15O60248 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOX15O60248 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOX15O60248 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms