Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DENRO43583 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DENRO43583 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DENRO43583 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DENRO43583 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DENRO43583 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENRO43583 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms