Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN8O00124 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms