Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00862A6NCI5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms